A.根据材料“以张学良为首的东北地方当局，公开宣布服从以蒋介石为首的南京国民政府，并在东北各省降下原北京政府时代的五色国旗，代之以南京国民政府的青天白日国旗“可知，东北易帜是国旗的变更，证明国民政府在形式上基本统一了全国，并不是政权的合并，故A选项错误；
B.根据材料可知，东北易帜是国旗的变更，证明国民政府在形式上基本统一了全国，故B选项正确；
C.材料主要说明的是国旗的变更，国民政府在形式上实现了国家统一，与民族融合无关，故C选项错误；
D.材料主要说明的是东北易帜是国旗的变更，代表国民政府在形式上实现了国家统一，与南北合流无关，故D选项错误。
故选：B。
