动画目录石英联盟01. 神奇宝贝，就决定是你了!（小智、小茂登场，小智得到皮卡丘）02. 神奇宝贝中心大对决（小霞加入，火箭队登场）03. 收服神奇宝贝!（小智收服绿毛虫并进化成铁甲蛹， 收服比比鸟）04. 武士少年的挑战（小智的铁甲蛹进化成巴大蝴）05.皮卡丘的决斗!（小刚加入，小智得到灰色徽章）06. 很多皮皮在这里（小刚收服超音蝠）07. 华蓝市的水中花（小智得到蓝色徽章）08. 通向神奇宝贝的擂台之路09. 神奇宝贝必胜指南10. 神奇宝贝乡的妙蛙种子（小智收服妙蛙种子）11. 走失的小火龙（小智得到小火龙）12.杰尼龟军团（小智收服杰尼龟）13. 正辉的灯塔（小智收服大钳蟹）14. 电击对决，枯叶道馆（小智得到橙色徽章）15. 圣安奴号之战16. 神奇宝贝漂流记!17. 巨大神奇宝贝之岛18. 蓝普鲁奇的度假日19. 玛瑙水母、毒刺水母（小霞收服墨海马）20.幽灵神奇宝贝和夏天庙会21. 巴大蝴再见（小智的巴大蝴离队）22.凯西，超能力大决斗23. 在神奇宝贝塔收服幽灵24.鬼斯通对抗超能力（小智得到黄金徽章）25.火爆猴，别生气哦!（小智收服火爆猴）26.艾莉嘉和臭臭花（小智得到彩虹徽章）27.索利柏与神奇宝贝催眠（小霞得到可达鸭）28. 美容街，饲育家大决斗（小刚得六尾）29. 格斗神奇宝贝大决斗（小智的火爆猴离队）30.小磁怪的电气老鼠之梦（小智收服臭臭泥）31. 好多地鼠（武藏的阿柏蛇进化成阿柏怪，小次郎的瓦斯弹进化成双弹瓦斯）32. 浅红道馆的忍者决斗（小智得到粉红徽章）33. 火焰的神奇宝贝大赛跑34.袋龙的摇篮曲35.迷你龙的传说（小智收服肯泰罗）36. 暴风雨的单车路37.百变怪跟模仿少女38. 皮卡丘的森林（原本是电脑战士3D龙）39. 伊布四兄弟40. 醒来吧!卡比兽!41. 神奇宝贝道馆的决斗42.椰蛋树军团大前进（小智的小火龙进化成火恐龙）43.派拉斯跟派拉斯特44.胖丁唱歌吧45. 复活?化石神奇宝贝（小智的火恐龙进化成喷火龙，得到蛋）46.吉利蛋的病历簿47.卡蒂狗跟小次郎48.大葱鸭的鸭49.波克比是谁的呢（小霞得到蛋孵化成的波可比）50. 妙蛙种子的不思议花园51. 激斗!神奇宝贝娃娃节（武藏收服大舌头）52. 儿童节全员大集合53. 警犬卡蒂狗54. 按快门的机会是皮卡丘55. 神奇宝贝鉴定考56.抚养家的秘密（亚马多、小三郎登场，小次郎的口呆花进化成大食花）57. 燃烧吧!红莲道馆58. 决战红莲道馆 （小智得到深红徽章）59. 水箭龟之岛60.华蓝道馆，水中战斗（小霞把墨海马和宝石海星存在道馆）61.皮皮对抗胖丁62. 常磐道馆，最后的徽章（小智得到绿色徽章）63. 神奇宝贝马戏团的吸盘魔偶（小智的妈妈得到吸盘魔偶）64.迷唇姐的圣诞节65. 用大岩蛇露营66. 宿敌大决斗，大木研究所67. 当呆呆兽变成呆河马的时候（武藏收服大舌贝，本集结束后大舌贝离队）68. 踏浪皮卡丘的传说69. 植物园的臭臭花70. 神奇宝贝电影71.喵喵之歌72. 四天王希巴登场73.激烈冲突 超古代神奇宝贝74.嘎啦嘎啦的骨头棒75. 开火!神奇宝贝联盟开幕式76. 神奇宝贝联盟开幕!水之场地（小智的大钳蟹归队，小智的大钳蟹进化成巨钳蟹）77. 冰之场地 火炎之战78. 草之场地 意外的强敌79. 劲敌登场（阿弘登场）80. 石英运动场VS阿弘（小智止步石英大会前16强）81. 神奇宝贝联盟 最后战斗
