抗生素种类繁多，且每一种抗生素都有各自不同的副作用。以下仅列举大多数抗生素常见的副作用，如过敏反应、胃肠道反应、毒性反应、二重感染等。1.过敏反应比如用药过程中可能会出现药物热，皮疹，瘙痒，肾炎、粒细胞减少、溶血性贫血、血栓性静脉炎、荨麻疹、血管神经性水肿、甚至过敏性休克等。青霉素类药物比较多见。2.胃肠道反应如恶心、呕吐、食欲下降等。多见于一些口服给药。3.毒性反应如链霉素，氯霉素常有耳毒性。氨基糖苷类的抗生素常可会引起肾功能损害。如果使用一些抗真菌药物，还有大环内酯类抗生素以及抗结核药物，比如像利福平，异烟肼等，还可能会出现肝脏功能损害。4.二重感染大剂量或者长期应用抗生素，特别是应用广谱抗生素，当敏感菌被杀灭或者被抑制，其他不敏感菌借机会大量生长繁殖。较易发生的二重感染有：难辨梭状芽胞杆菌肠炎、霉菌性肠炎、口腔霉菌感染、白色念珠菌阴道炎等。抗生素种类繁多，不良反应也相应较多，应严格在医生的指导下用药，避免严重后果。
