头骨发育不良可能是遗传因素、营养不良、外伤等原因导致的。
1、遗传因素
如果父母的头骨都比较小，受到遗传因素的影响，其后代的头骨也会比较小，这种情况属于正常的现象，一般不需要特殊的治疗。
2、营养不良
如果在生长发育时期，不注意合理饮食，经常挑食或偏食，可能会导致体内的营养缺乏，影响头骨的生长发育，出现头骨发育不良的情况。建议改变不良的饮食习惯，均衡饮食。
3、外伤
如果头部受到外伤，可能会导致头骨出现凹陷的情况，并且会伴随疼痛的症状。建议遵医嘱使用红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物治疗。
除此之外，还可能与颅内压增高、脑膜炎等原因有关，建议及时就医治疗。
